Team:Evry/Model1/vf

From 2013.igem.org

Iron coli project

Modèle 1

Aperçu

Ce modèle simule le comportement à l'échelle du duodénum d'une personne souffrant d'hémochromatose. Nous l'avons utilisé pour quantifier la quantité de fer absorbé par l'organisme. Une fois notre bactérie génétiquement modifiée dans le duodénum, elles produisent des sidérophores pour chélater le fer soluble, empêchant ainsi son absorption par l'intestin. Ensuite, elles quittent éventuellement le duodénum. L'hypothèse principale de ce modèle est que les bactéries ne colonisent pas le duodénum : elles ne font que le traverser.
Le but de ce modèle est donc de mesurer l'efficacité potentiel de ce traitement.

Hypothèses

  • Nos bactéries ne restent pas dans le duodénum
  • Il n'y a pas de régulation du fer
  • Le flux de fer est constant
  • Le fluide est homogène
  • La quantité de bactérie est constante
  • L'absorption naturelle du fer par la bactérie est négligeable par rapport à la chélation par les sidérophores

Description du Modèle

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Système d'Equations

text to print if image not found A : Quantité totale de fer absorbé par le duodénum (mol)
S : Quantité de fer soluble (mol)
P : Quantité total d'entérobactine produite par la population de bactérie (mol)
Q : Quantité totale de fer chélaté (mol)
N : Nombre de bactérie

Système d'équation

Résultats

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Conclusion

Il est possible de réduire l'absorption de fer de 50% si le patient prend un médicament à chaque repas. Cela signifie que le patient pourra bénéficier d'un traitement moins invasif: moins de saignée pour les malades souffrant d'hémochromatose, et moins d'effets secondaires du aux chélateurs de fer pour les thalassémiques.

Références:

  1. Computational Modeling and Simulation of the Human Duodenum - B. Hari, S. Bakalis, P. Fryer - 2012