Team:TU Darmstadt/labbook

From 2013.igem.org

(Difference between revisions)
Line 99: Line 99:
!align="center"|[[Team:TU_Darmstadt/materials|<span style="color:white;font-size:160%;"> Materials |</span>]]
!align="center"|[[Team:TU_Darmstadt/materials|<span style="color:white;font-size:160%;"> Materials |</span>]]
|}
|}
 +
 +
<html>
 +
<head>
 +
<title></title>
 +
<meta name="author" content="Anne Schieferdecker">
 +
<meta name="editor" content="html-editor phase 5">
 +
</head>
 +
<body>
 +
      <table border="1" rules="rows"  >
 +
        <tr>
 +
                <td>13.08</td>
 +
                <td>gBLOCK assembly of CMK and TLO</td>
 +
                <td></td>
 +
        </tr>
 +
        <tr>
 +
                <td></td>
 +
                <td><ul><li>PCR mixture
 +
                                <ul><li>1 µL of each gBLOCK
 +
                                <ul>
 +
                                        <li>CMK: B_01 - B_04</li>
 +
                                        <li>TLO: A_01 - A_06</li>
 +
                                </ul></li>
 +
                                <li>10 µL 5x Q5 Reaction Buffer</li>
 +
                                <li>2 µL dNTPs</li>
 +
                                <li>1 µL Q5 Hot Start Polymerase</li>
 +
                                <li>10 µL 5x Q5 High GC Enhancer</li>
 +
                                <li>1 µL primer suffix-R (10 mM)</li>
 +
                                <li>1 µL primer prefix_R (10 mM)</li>
 +
                        </ul></ul></li>
 +
                        <ul><li>PCR program (40 cycles)
 +
                                <ul><li>initial denaturation 94°C, 100s</li>
 +
                                <li>denaturation 94°C, 55s</li>
 +
                                <li>annealing 64°C, 55s</li>
 +
                                <li>elongation 72°C, 120s</li>
 +
                                <li>final elongation 72°C, 300s</li>
 +
                        </li></ul></ul>
 +
                        <ul><li>preparative 1% agarose gel
 +
                                <ul><li>gel displays bands of expected size ' assembly was successful</li>
 +
                        </ul></li></ul>
 +
                </td>
 +
                <td></td>
 +
        </tr>
 +
      </table>
 +
</body>
 +
</html>

Revision as of 11:06, 3 October 2013

Labbook | Protocols | Materials |

13.08 gBLOCK assembly of CMK and TLO
  • PCR mixture
    • 1 µL of each gBLOCK
      • CMK: B_01 - B_04
      • TLO: A_01 - A_06
    • 10 µL 5x Q5 Reaction Buffer
    • 2 µL dNTPs
    • 1 µL Q5 Hot Start Polymerase
    • 10 µL 5x Q5 High GC Enhancer
    • 1 µL primer suffix-R (10 mM)
    • 1 µL primer prefix_R (10 mM)
  • PCR program (40 cycles)
    • initial denaturation 94°C, 100s
    • denaturation 94°C, 55s
    • annealing 64°C, 55s
    • elongation 72°C, 120s
    • final elongation 72°C, 300s
  • preparative 1% agarose gel
    • gel displays bands of expected size ' assembly was successful

Retrieved from "http://2013.igem.org/Team:TU_Darmstadt/labbook"