Notebook : August 1

Lab work

A - Aerobic/Anaerobic regulation system / B - PCB sensing system

Objective : obtaining FNR and BphR2 proteins

1 - Gel purification of PCR products : BphR2 Part I, BphR2, Part II, FNR Part I, FNR Part II, RBS-FNR Part I, PSB1C3

Xavier

Protocol : Gel purification

Nanodrop :

• BphR2 Part I : 44 ng/µL
• BphR2 Part II : 64 ng/µL
• FNR Part I : 147 ng/µL
• FNR Part II : 140 ng/µL
• RBS-FNR Part I : 167 ng/µL
• PSB1C3 : 159 ng/µL

2 - Gibson assembly.

Abdou, Xiaojing

Used quantities :

• BphR2 :
  • PSB1C3 : 2µL
  • BphR2 Part I : 1µL
  • BphR2 Part II : 1µL
  • Gibson mix : 15µL
  • H2O : 1µL

• FNR :
  • PSB1C3 : 2µL
  • FNR Part I : 1µL
  • FNR Part II : 1µL
  • Gisbon mix : 15µL ???????????????
  • H2O : 1µL

• RBS-FNR :
  • PSB1C3 : 2µL
  • RBS-FNR Part I : 1µL
  • FNR Part II : 1µL
  • Gibson mix : 15µL ????????????
  • H2O : 1µL

We let these mix at 50°C during 1h.

3 - PCR of : RBS-BphR2 Part I

Abdou

Used quantities :

• • Oligo 54F : 1µL
  • Oligo 55R : 1µL
  • Buffer phusion : 5µL
  • DNA : 0.25µL
  • dNTP : 1µL
  • Phusion : ... µL 5 ?????????
  • H2O : 36.5µL

PCR Program :

3 - Electrophoresis of the PCR products : RBS-BphR2 Part I

Xavier, XiaoJing

Expected sizes :

• RBS-BphR2 Part I : ....

4 - Gel purification of PCR of : RBS-BphR2 Part I

????????