Notebook : July 15

Lab work

A - Aerobic/Anaerobic regulation system

Objective : obtaining Bba_K1155000

1 - Sequensis analysis of Bba_K1155000

Abdou

WE OUR FIRST BIOBRICK ! The sequence analysis was good. We call our biobrick Bba_K1155000.

Objective : obtaining Bba_K1155003, bba_K1155007

1 - Liquid culture of Bba_B0010, Bba_B0015, Bba_B0017, Bba_I732019

Sheng, Zhou

We used 5 colonies of each plasmid.

2 - Digestion of Bba_B0010 by EcoRI/PstI

Anaïs

Used quantities :

• DNA : 20µL
• Buffer FD : 3µL
• EcoRI : 1µL
• PstI : 1µL
• H2O : 5µL

We let our digestion 1h30 at 37°C.

B - PCB sensor system

Objective : obtaining Bba_K1155001, Bba_K1155002, BphR2

1 - Digestion of Bba_K11001, Bba_K1155002 and BphR2 in PSB1C3 by EcoRI/PstI and SacII to check the size of fragments

Abdou

Used quantities :

• EcoRI/PstI :
  • DNA : 8µL
  • Buffer Orange : 1.6µL
  • EcoRI : 1µL
  • PstI : 1µL
  • H2O : 4.4µL

• SacII :
  • DNA : 8µL
  • Buffer Blue : 1.6µL
  • SacII : 1µL
  • H2O : 5.4µL

We let the digestion 1h30 at 37°C.

3 - PCR of digestion of Bba_K11001, Bba_K1155002 and BphR2 in PSB1C3

Anaïs, Sheng, Zhou

Used quantities :

.....

COLONIES PIQUEES DANS 20µL d'eau pour chaque colonie.

Used quantities :

• BphA1 or BphR1 or BphR2 : 2µL
• Mix : (it was divided in 2 tubes for each oligo combinaison with 23µL of mix in each tube)
  • VF or Pfnr_Up : 6µL
  • VR or Pfnr_Down or VR : 6µL
  • dNTP : 6µL
  • Buffer Dream Taq : 30µL
  • Dream Taq : 6µL
  • H2O : 246µL

....

PCR Program :

• BphR1 :

• BphA1, BphR2 :