Team:Paris Saclay/Notebook/July/30

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Abdou, Xavier
Abdou, Xavier
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Used quantities :
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* Bphr2 Part I :
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** Oligo 54F : 4 µL
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** Buffer .... : 40 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** .... : 1 µL
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** H2O : 146 µL
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** Oligo 55R :4 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** H2O : 146 µL
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** Oligo 54F : 4 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** H2O : 146 µL
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** Oligo ... : 4 µL
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** Buffer .... : 40 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** H2O : 146 µL
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* FNR Part II :
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** Oligo ... : 4 µL
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** Oligo ... :4 µL
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** Buffer .... : 40 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** .... : 1 µL
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** H2O : 146 µL
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* RBS-FNR Part I :
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** Oligo ... : 4 µL
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** Oligo ... :4 µL
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** Buffer .... : 40 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** .... : 1 µL
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** H2O : 146 µL
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* PSB1C3 :
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** Prefixe ... : 4 µL
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** Suffixe ... :4 µL
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** Buffer .... : 40 µL
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** DNA : 2 µL
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** dNTP : 4 µL
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** .... : 1 µL
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** H2O : 146 µL
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PCR Program :
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* BphR2 Part I, BphR2 Part II, RBS-BphR2 Part I :
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Revision as of 18:19, 15 September 2013

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Contents

Notebook : July 30

Lab work

A - Aerobic/Anaerobic regulation system

Objective : obtaining Bba_K1155004, Bba_K1155005, Bba_K1155006

1 - Denaturation of EcoRI/SpeI used of the digestion of PCR products : NarK, NarG, NirB

Xavier

Protocol : Ethanol precipitation

We used 30µL of DNA.

Objective : obtaining Bba_K1155003

1 - Tranformation of RBS-AmilCP in PSB1C3 in DH5α

Abdou

Protocol : Bacterial transformation

A - Aerobic/Anaerobic regulation system / B - PCB sensor system

Objective : obtaining FNR and BphR2 proteins (Gibson assembly)

1 - PCR of : BphR2 Part I, BphR2 Part II, RBS-BphR2 Part I, FNR Part I, FNR Part II, RBS-FNR Part I

Abdou, Xavier

Used quantities :

  • Bphr2 Part I :
    • Oligo 54F : 4 µL
    • Oligo 55R :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL
  • Bphr2 Part II :
    • Oligo 54F : 4 µL
    • Oligo 55R :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL
  • RBS-Bphr2 Part I :
    • Oligo 54F : 4 µL
    • Oligo 55R :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL
  • FNR Part I :
    • Oligo ... : 4 µL
    • Oligo ... :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL
  • FNR Part II :
    • Oligo ... : 4 µL
    • Oligo ... :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL
  • RBS-FNR Part I :
    • Oligo ... : 4 µL
    • Oligo ... :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL
  • PSB1C3 :
    • Prefixe ... : 4 µL
    • Suffixe ... :4 µL
    • Buffer .... : 40 µL
    • DNA : 2 µL
    • dNTP : 4 µL
    • .... : 1 µL
    • H2O : 146 µL

PCR Program :

  • BphR2 Part I, BphR2 Part II, RBS-BphR2 Part I :

[File:PsPCRBphR23007.jpg|400px]]

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