Notebook : July 30

Lab work

A - Aerobic/Anaerobic regulation system

Objective : obtaining Bba_K1155004, Bba_K1155005, Bba_K1155006

1 - Denaturation of EcoRI/SpeI used of the digestion of PCR products : NarK, NarG, NirB

Xavier

Protocol : Ethanol precipitation

We used 30µL of DNA.

Objective : obtaining Bba_K1155003

1 - Tranformation of RBS-AmilCP in PSB1C3 in DH5α

Abdou

Protocol : Bacterial transformation

A - Aerobic/Anaerobic regulation system / B - PCB sensor system

Objective : obtaining FNR and BphR2 proteins (Gibson assembly)

1 - PCR of : BphR2 Part I, BphR2 Part II, RBS-BphR2 Part I, FNR Part I, FNR Part II, RBS-FNR Part I

Abdou, Xavier

Used quantities :

• Bphr2 Part I :
  • Oligo 54F : 4 µL
  • Oligo 55R :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

• Bphr2 Part II :
  • Oligo 54F : 4 µL
  • Oligo 55R :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

• RBS-Bphr2 Part I :
  • Oligo 54F : 4 µL
  • Oligo 55R :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

• FNR Part I :
  • Oligo ... : 4 µL
  • Oligo ... :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

• FNR Part II :
  • Oligo ... : 4 µL
  • Oligo ... :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

• RBS-FNR Part I :
  • Oligo ... : 4 µL
  • Oligo ... :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

• PSB1C3 :
  • Prefixe ... : 4 µL
  • Suffixe ... :4 µL
  • Buffer .... : 40 µL
  • DNA : 2 µL
  • dNTP : 4 µL
  • .... : 1 µL
  • H2O : 146 µL

PCR Program :

• BphR2 Part I, BphR2 Part II, RBS-BphR2 Part I :

• FNR Part I, FNR Part II, RBS-FNR Part I :

• PSB1C3 :

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