Team:Calgary/TestPage

From 2013.igem.org

(Difference between revisions)
 
(53 intermediate revisions not shown)
Line 1: Line 1:
-
<!DOCTYPE html>
+
{{Team:Calgary/Main}}
<html>
<html>
-
<head>
+
 
-
<title>Carousel</title>
+
<section id="Content">
-
+
 
-
<!-- Reset for BodyContent -->
+
<h1>Quantitative App</h1>
-
<style>
+
 
-
#content{
+
<h2>DNA binding to TALEs<h2>
-
width: 100%;
+
 
-
margin: 0;
+
<p>The positive DNA&#39;s are colored red, negative DNA is green, TALEs are black and after binding (i.e. saturation) they turn blue. The sliders under &quot;global settings&quot;€ are parameters needed before the simulation runs. Given that a simulation can take 30 seconds to complete, they should not be changed frequently as it will take longer to show the results. The sliders under &quot;€œdisplay settings&quot;€ are parameters needed after the simulation runs. Their responses are much faster and are best played by clicking on the plus sign to the right and hit &quot;€œPlay&quot;. If you only see a grey box, you may need to install the Mathematica CDF Player. The download link can be found <a href="http://www.wolfram.com/cdf-player/">here</a>. Otherwise, the data from our model, as well as images of the app we designed, can be found on the <a href="https://2013.igem.org/Team:Calgary/Project/OurSensor/Modelling/QuantitativeModelling">quantitative modelling page</a>.
-
padding: 0;
+
</p>
-
background-color:transparent;
+
 
-
border: none;
+
<img align="right" style="width:35%;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2013/6/6b/UCalgary2013SWAgenModelInstruction.jpg" style="float: left; clear: both;"></img>
-
}
+
 
-
+
<script type="text/javascript" src="http://www.wolfram.com/cdf-player/plugin/v2.1/cdfplugin.js"></script>
-
#bodyContent{
+
<script type="text/javascript">
-
width: 100%;
+
var cdf = new cdfplugin();
-
margin: 0;
+
cdf.embed('http://igem.ucalgary.ca/misc/Deployed.cdf', 430, 800);
-
padding: 0;
+
-
background-color:transparent;
+
-
border: none;
+
-
}
+
-
</style>
+
-
+
-
<!-- Fonts -->
+
-
<link href='http://fonts.googleapis.com/css?family=Raleway:400,500,600' rel='stylesheet' type='text/css'>
+
-
<link href='http://fonts.googleapis.com/css?family=Antic+Slab' rel='stylesheet' type='text/css'>
+
-
+
-
<!-- CSS Stylesheets -->
+
-
<link href="https://2013.igem.org/Team:Calgary/StyleSheets/Reset?action=raw&ctype=text/css" rel="stylesheet">
+
-
<link href="CarouselCSS.css" rel="stylesheet">
+
-
<link href="https://2013.igem.org/Team:Calgary/TestPageCSS?action=raw&ctype=text/css" rel="stylesheet">
+
-
+
-
<!-- JavaScript & JQuery -->
+
-
<script>
+
-
$(document).ready(function() {
+
-
var preloadImages = ['Num0.png','Num1.png','Num2.png','Num3.png','Num4.png','Num5.png','Num6.png','Num7.png','Num8.png','Num9.png',];
+
-
var images = [];
+
-
for (var count = 0; count < preloadImages.length; count++) {
+
-
images[count] = new Image();
+
-
images[count].src = preloadImages[count];
+
-
}
+
-
+
-
var TotalSlides = $('.Person').length
+
-
var CurrentSlide = 0;
+
-
+
-
$('#Carousel').css('display', 'block');
+
-
$('.Info').css('display', 'none');
+
-
$('#Bio' + ((CurrentSlide + TotalSlides + 2) % TotalSlides)).css('display', 'block');
+
-
+
-
$('#RightArrow').click(function() {
+
-
CurrentSlide = ++CurrentSlide % TotalSlides;
+
-
$('.Person').css('display', 'none');
+
-
var i = CurrentSlide;
+
-
+
-
for (var count = 0; count < 5; count++) {
+
-
if (i >= TotalSlides)
+
-
i = 0;
+
-
+
-
$('.Person').removeClass('Slide' + count);
+
-
+
-
SlideID = '#Person' + i;
+
-
$(SlideID).css('display', 'block').addClass('Slide' + count);
+
-
i++;
+
-
}
+
-
+
-
$('.Info').css('display', 'none');
+
-
$('#Bio' + ((CurrentSlide + TotalSlides + 2) % TotalSlides)).css('display', 'block');
+
-
});
+
-
+
-
$('#LeftArrow').click(function() {
+
-
CurrentSlide = (CurrentSlide + TotalSlides - 1) % TotalSlides;
+
-
$('.Person').css('display', 'none');
+
-
var i = CurrentSlide;
+
-
+
-
for (var count = 0; count < 5; count++) {
+
-
if (i >= TotalSlides)
+
-
i = 0;
+
-
+
-
$('.Person').removeClass('Slide' + count);
+
-
+
-
SlideID = '#Person' + i;
+
-
$(SlideID).css('display', 'block').addClass('Slide' + count);
+
-
i++;
+
-
}
+
-
+
-
$('.Info').css('display', 'none');
+
-
$('#Bio' + ((CurrentSlide + TotalSlides + 2) % TotalSlides)).css('display', 'block');
+
-
});
+
-
+
-
$('.Person').click(function() {
+
-
var ClickedPerson = $(this).attr('id');
+
-
CurrentSlide = ((parseInt(ClickedPerson.replace('Person', ''))) + TotalSlides - 2) % TotalSlides;
+
-
+
-
$('.Person').css('display', 'none');
+
-
var i = CurrentSlide;
+
-
+
-
for (var count = 0; count < 5; count++) {
+
-
if (i >= TotalSlides)
+
-
i = 0;
+
-
+
-
$('.Person').removeClass('Slide' + count);
+
-
+
-
SlideID = '#Person' + i;
+
-
$(SlideID).css('display', 'block').addClass('Slide' + count);
+
-
i++;
+
-
}
+
-
+
-
$('.Info').css('display', 'none');
+
-
$('#Bio' + ((CurrentSlide + TotalSlides + 2) % TotalSlides)).css('display', 'block');
+
-
});
+
-
});
+
</script>
</script>
-
</head>
 
-
<body>
+
<h2>Enzyme kinetics of horseradish peroxidase</h2>
-
<div id="TeamMembers">
+
 
-
<div id="Carousel">
+
<script type="text/javascript" src="http://www.wolfram.com/cdf-player/plugin/v2.1/cdfplugin.js"></script>
-
<div id="LeftArrow" class="Arrow"></div>
+
<script type="text/javascript">
-
<div id="Person0" class="Person Slide0"></div>
+
var cdf = new cdfplugin();
-
<div id="Person1" class="Person Slide1"></div>
+
cdf.embed('http://igem.ucalgary.ca/misc/HorseradishPeroxidase.cdf', 350, 360);
-
<div id="Person2" class="Person Slide2"></div>
+
</script>
-
<div id="Person3" class="Person Slide3"></div>
+
 
-
<div id="Person4" class="Person Slide4"></div>
+
<h2>Enzyme kinetics of beta-galactosidase</h2>
-
<div id="Person5" class="Person"></div>
+
 
-
<div id="Person6" class="Person"></div>
+
<script type="text/javascript" src="http://www.wolfram.com/cdf-player/plugin/v2.1/cdfplugin.js"></script>
-
<div id="Person7" class="Person"></div>
+
<script type="text/javascript">
-
<div id="Person8" class="Person"></div>
+
var cdf = new cdfplugin();
-
<div id="Person9" class="Person"></div>
+
cdf.embed('http://igem.ucalgary.ca/misc/Beta-Galactosidase.cdf', 350, 330);
-
<div id="RightArrow" class="Arrow"></div>
+
</script>
-
</div>
+
 
-
+
<h2>Frequently Asked Questions
-
<div id="WriteUp">
+
</h2>
-
<div id="Bio0" class="Info">
+
 
-
<img src="Pic0.jpg">
+
<h3>1. Can I see your code?
-
<div class="Text">
+
</h3>
-
<h2>Bio 0 Person</h2>
+
<p>Sure! Here are <a href="https://static.igem.org/mediawiki/2013/3/3a/UCalgary2013SWTheCode.txt" target="_blank">DNA binding to TALEs agent based model</a>,
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
<a href="https://static.igem.org/mediawiki/2013/b/b5/UCalgary2013SWHorseradishPeroxidaseCode.txt" target="_blank">horseradish peroxidase kinetic model</a>, and
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
<a href="https://static.igem.org/mediawiki/2013/0/08/UCalgary2013SWBeta-GalactosidaseCode.txt " target="_blank">beta-galactosidase kinetic model</a>.
-
</div>
+
</p>
-
</div>
+
 
-
<div id="Bio1" class="Info">
+
<h3>2. I see a block of text with red background. What should I do?
-
<img src="Pic1.jpg">
+
</h3>
-
<div class="Text">
+
<p>Don&#39;t worry, everything is under control. For the DNA binding to TALEs agent based model, wait for at least 30 seconds. If the problem persists, reset the current time to 1. For the kinetic models, use the plus/minus sign to change the parameters, or simply hit auto-run on the upper-right corner.
-
<h2>Bio 1 Person</h2>
+
</p>
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
 
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
</section>
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio2" class="Info">
+
-
<img src="Pic2.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 2 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio3" class="Info">
+
-
<img src="Pic3.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 3 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio4" class="Info">
+
-
<img src="Pic4.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 4 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio5" class="Info">
+
-
<img src="Pic5.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 5 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio6" class="Info">
+
-
<img src="Pic6.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 6 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio7" class="Info">
+
-
<img src="Pic7.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 7 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio8" class="Info">
+
-
<img src="Pic8.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 8 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
<div id="Bio9" class="Info">
+
-
<img src="Pic9.jpg">
+
-
<div class="Text">
+
-
<h2>Bio 9 Person</h2>
+
-
<p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam non dui rutrum, ultrices turpis ut, dignissim lectus. Aenean ac viverra urna. Praesent tempor rhoncus scelerisque. Pellentesque volutpat elementum tristique. Maecenas iaculis quam nunc, vel venenatis sapien pretium id. Nulla facilisi. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Maecenas adipiscing congue augue, at sagittis lorem pretium eu. Nullam sit amet lacinia neque, et luctus diam. Vestibulum porta adipiscing venenatis.</p>
+
-
<p>Donec pulvinar diam diam, sed ornare erat ultricies non. Nunc faucibus lorem vitae nisi pretium, ac fermentum orci dapibus. Donec diam metus, tempus sit amet euismod ac, ullamcorper quis nisl. Nulla facilisi. Fusce dapibus non mi a rhoncus. Nam laoreet quis lacus nec aliquam. Nunc eu odio nibh. Etiam eleifend libero nec quam convallis, at tincidunt est faucibus. Fusce tempor ante nulla, sit amet suscipit urna dapibus tincidunt. Duis et dignissim sem. Integer luctus metus nec leo convallis laoreet. Etiam molestie nisl a mollis pharetra. Nam et neque egestas urna sodales eleifend. Aliquam sodales quam augue, nec placerat magna convallis et. Aenean commodo diam sed nulla aliquam fringilla.</p>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
</div>
+
-
</body>
+
</html>
</html>

Latest revision as of 03:19, 28 September 2013

Quantitative App

DNA binding to TALEs

The positive DNA's are colored red, negative DNA is green, TALEs are black and after binding (i.e. saturation) they turn blue. The sliders under "global settings"€ are parameters needed before the simulation runs. Given that a simulation can take 30 seconds to complete, they should not be changed frequently as it will take longer to show the results. The sliders under "€œdisplay settings"€ are parameters needed after the simulation runs. Their responses are much faster and are best played by clicking on the plus sign to the right and hit "€œPlay". If you only see a grey box, you may need to install the Mathematica CDF Player. The download link can be found here. Otherwise, the data from our model, as well as images of the app we designed, can be found on the quantitative modelling page.

Enzyme kinetics of horseradish peroxidase

Enzyme kinetics of beta-galactosidase

Frequently Asked Questions

1. Can I see your code?

Sure! Here are DNA binding to TALEs agent based model, horseradish peroxidase kinetic model, and beta-galactosidase kinetic model.

2. I see a block of text with red background. What should I do?

Don't worry, everything is under control. For the DNA binding to TALEs agent based model, wait for at least 30 seconds. If the problem persists, reset the current time to 1. For the kinetic models, use the plus/minus sign to change the parameters, or simply hit auto-run on the upper-right corner.

Retrieved from "http://2013.igem.org/Team:Calgary/TestPage"