Team:Evry/HumanPractice/Expert consultation

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<h1>Consultation of experts</h1>
<h1>Consultation of experts</h1>
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<p><em>During our project, we contacted different experts on hemochromatosis : patients, clinicians and specific researchers.</em>
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<h2>Discussion with Gaël Nicolas</h2>
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<h2>The scientific point of view</h2>
<img src='https://static.igem.org/mediawiki/2013/7/76/GN.jpg' alt='Gaël Nicolas' align='left' style="margin-right:20px;" height='200px'/>  
<img src='https://static.igem.org/mediawiki/2013/7/76/GN.jpg' alt='Gaël Nicolas' align='left' style="margin-right:20px;" height='200px'/>  
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Professor Gaël Nicolas is a French scientist who is working on the regulation of hepcidin expression. He described in 2001 for the first time the role of this hormon in the regulation of iron homeostasis. <br>(See <a href='http://cvscience.aviesan.fr/cv/76/gael-nicolas' target='_blank'>Gaël Nicolas resume</a> for more information)
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<p>Doctor Gaël Nicolas is a French scientist who is working on the regulation of hepcidin expression. He described in 2001 for the first time the role of this hormone in the regulation of iron homeostasis in mammals. <br>
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<small>(See <a href='http://cvscience.aviesan.fr/cv/76/gael-nicolas' target='_blank'>Gaël Nicolas resume</a> for more information)</small><br/><br/>
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The meeting took place at Cochin Institut, on the 18 June 2013.</p><br/>
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<p>We first presented the aim of iGEM competition and iGEM Evry team to Gaël Nicolas. We mentioned the pluridisciplinary aspect of iGEM: biology, engineering, mathematic and informatic modelling and ethic and philosophic reflection on our project ; this aspect interested Dr. Nicolas very much.<br/>
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La réunion s'est déroulée à l'Institut Cochin, ce mardi 18 juin 2013 de 10h00 à 11h45, entre les participants indiqués ci-dessus. <br><br>
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We then described our experimental strategy to create a bacteria that can chelate iron: our goal is to design a bacteria that produces a massive amount of siderophores when iron from food arrives.<br/>
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We then presented the different parts of modelling: bacterial growth of our bacteria, risks for patients, amount of absorbed chelated, modelling of the intestine.<br/>
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Finally we discussed the use of microfluidics to study the ability of our bacteria to chelate iron.<br/><br/>
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Après un tour de table pour nous présenter, Nicolas et Emiel (veuillez me pardonner si je fais des erreurs au niveau des orateurs) ont présenté le but de cette compétition internationale ainsi que l'iGEM Evry 2013. Il y a été clairement mentionné l'aspect pluridisciplinaire qui, selon moins, est particulièrement intéressant : de ce que j'ai pu retenir, le projet comporte une partie ingénierie, une partie de modélisation informatique et/ou mathématique, une réflexion éthique et philosophique sur l'impact sociétale avec une étude des marchés potentiels concernés par la visée applicative du projet.<br>
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Gaël Nicolas then focused on some points:
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<li>Naturally, there are not a lot of bacteria in the duodenum (only 10 to 100 bacteria for each gram
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of matter). But we underlined that could be an advantage for our project, and Dr. Nicolas agreed with us.</li>
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Guillaume a décrit l'hémochromatose puis a présenté la stratégie expérimentale pour fabriquer une bactérie capable de chélater le fer. Le but est de créer une bactérie produisant une quantité très importante du sidérophore au moment où arrive le pulse de fer alimentaire (au moment du repas donc). Je n'ai pas retenu exactement la stratégie technique si ce n'est qu'elle est inductible par l'IPTG (un analogue du lactose). D'ailleurs après réflexion, une fois que des modèles murins seront testés il peut tout à fait être envisagé de faire boire à la souris +/- de lactose (via un gavage) afin d'activer ou d'inactiver l'opéron lactose qui contrôle l'expression du sidérophore : dans le futur il suffirait alors au patient de prendre une pilule de ce probiotique avec un verre de lait ! Une autre stratégie visant à implanter dans la membrane bactérienne des peptides capables de lier le fer a été proposée, mais il a été reconnue qu'elle était vraisemblablement plus difficile. Je partage cet avis.<br>
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<li>Incomplete penetrance (<i>proportion of individuals carrying a particular variant of a gene which express an associated trait</i>) with homozygote HFE C282Y mutation (<i>responsible of more than 95% of genetic <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Hemochromatosis">hemochromatosis</a></i>). There is a 1:300 proportion of French population that have homozygote HFR C282Y mutation but all of them do not develop <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Hemochromatosis">hemochromatosis</a>, which reduces the proportion of people that could be interested by our treatment.</li>
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Léni a présenté la partie concernant la modélisation avec différents aspects : 1/ modéliser la croissance des bactéries qui chélatent le fer. 2/ Risque pour le patient. 3/Quantité de fer chélatée. 4/ Modéliser l'instestin.<br>
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<li><a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Thalassemia">Thalassemia</a> seems like more appropriate for the application of our project. <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Thalassemia">Thalassemia</a> is severe anemia due to a defect in hemoglobin’s globin (alpha or beta) production. There is a default of red cells production. The only way to treat this anemia is blood transfusion. But each transfusion also provides a huge amount of iron: 200 mg (as total iron in human body is between 3 and 5 grams, the mass of a nail!). After a dozen transfusions, patients develop a secondary iron overload also called secondary <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Hemochromatosis">hemochromatosis</a> (<i>secondary to transfusion</i>).<br/>
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Furthermore, their organisms “misinterpret” this anemia: anemia is perceived as a result of lack of iron. Hence, there is a repression of hepcidin hormone synthesis (<i>which regulates negatively iron absorption in the intestines</i>).<br/>
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The consequence is that there is a massive absorption of alimentary iron (10 to 20 times more than a healthy person). Due to this iron absorption, iron overload in blood is even more important, it is a vicious circle! This is really terrible since, because of their anemia, bloodletting is impossible!<br/>
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The only treatment to decrease this dangerous iron overload is the administration by perfusion of an iron chelator, 12 hours a day, 5 days a week; which is very difficult for patients.
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Oral iron chelator Exjade (Deferasirox) is very problematic because of the important side effects (e.g. renal failure). It is actively keep under surveillance by the French Agency for the Safety of Health Products (APFSAP).
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Iron chelator treatments are used during the whole life of <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Thalassemia">thalassemia</a> patients because most of them die of iron overload, more than from anemia. <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Thalassemia">Thalassemia</a> patients are people who have a very important disease and alternative treatment would be a good thing.</li>
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<li>Gaël Nicolas also told us that heminic iron (<i>from meat</i>) is very important source of iron, we have to take that into account.</li>
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<li> He finally reminded us to check affinities of aerobactin and enterobactin (<i>two bacterial siderophors</i>) for iron.</li>
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</ul>
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Un dernier aspect évoqué est celui d'expérimentation en flux liquide continu : les bactéries "recombinantes" seraient bloquées dans des microcanaux et elles recevraient un régime plus ou moins riche en fer. L'intérêt de l'expérience est de créer et mimer, d'une certaine façon, une absorption de fer par la bactérie qui soit dynamique (le bol alimentaire dans lequel se trouve le fer alimentaire se déplace vite et reste peu de temps en contact dans le duodénum).<br>
 
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J'ai ensuite voulu attirer l'attention sur certains poins, notamment : <br>
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<p>We then opened a discussion and a series of questions and answers:<br/>
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- la pénétrance clinique incomplète de l'hémochromatose avec mutation homozygote HFE C282Y. Une français sur 300 est homozygote pour la mutation HFE C282Y mais tous ne développent pas une hémochromatose. Cela réduit donc le marché des hémochromatoses pour la visée applicative.<br>
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<b>Q1: How much iron can a hemochromatosis patient absorb? </b><br/>
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- j'ai insisté sur la pauvreté naturelle du duodénum en bactéries (seulement entre 10 et 1000 bactérie par gramme de matière). Emiel a souligné que cela pouvait représenté un avantage. Il a raison.<br>
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10 times the amount of a healthy person. A balanced diet of a European type provides 20 milligram of iron but just 1 milligram is absorb by organism. In <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Hemochromatosis">hemochromatosis</a> patient, it could go to 10 milligrams and even higher in severe cases.<br/>
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- plus encore que l'hémochromatose, la thalassémie semble plus adéquate pour une visée applicative d'une bactérie crée par l'iGEM Evry 2013. Pour rappel : les thalassémies sont des anémies sévères dues à un défaut de production de l'une des globines (alpha ou beta) de l'hémoglobine. Il y a un donc un défaut de production des globules rouges. Le seul traitement efficace pour améliorer cette anémie est de transfuser les patients. Mais chaque transfusion apporte une quantité de fer énorme : 200 mg (pour comparaison la quantité de fer totale chez un humain oscille entre 3 et 5 grammes - soit le poids d'un clou !). Après quelques dizaines de transfusion le patient développera donc une surcharge en fer que l'on dit "secondaire" (car secondaire aux transfusions). Deuxième problème majeur chez ces patients. Leur organisme interprète mal cette anémie et pense que si elle est en place c'est parce qu'il n'y a pas assez de fer. Il se met alors à complètement réprimer la synthèse de l'hormone hepcidine (dont le rôle est, entre autre, de freiner l'absorption du fer alimentaire). La conséquence est une absorption massive du fer alimentaire (10 à 20 fois plus qu'une personne saine). Du fait de cette absorption de fer la surcharge devient encore plus grave. Ce qui est catastrophique c'est qu'on ne peut pas saigner les thalassémiques puisqu'ils sont anémiques ! Le seul traitement pour diminuer cette surcharge qui les tue c'est l'administration sous perfusion (durée de la perfusion : 12 heures) d'un chélateur de fer et cela 5 jours par semaine. C'est donc extrêmement contraignant. L'utilisation du chélateur de fer oral Exjade (Deferasirox) est problématique à cause d'effets secondaires potentiellement très graves (il est activement surveillé par l'AFSSAP). J'insiste sur le fait que les traitements à base de chélateur de fer sont des traitements à vie chez la thalassémiques car ils meurent majoritairement de leur surcharge en fer et peu des conséquences de l'anémie. Une visée applicative envers les thalassémies me semble dont beaucoup plus pertinente et "intéressante" du point de vue de l'impact sociétal (= du point de vue du patient thalassémique) cela d'autant plus que bien que semblant très archaïque la saignée chez les hémochromatosiques primaires est très efficace. Et encore une fois on ne peut pas saigner les thalassémiques. On peut considérer que les thalassémiques sont des personnes très gravement malades et que des alternatives thérapeutiques sont vivement souhaitées.<br>
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<b> Q2: Would it be interesting to act directly on the hepcidin hormone? </b><br/>
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***
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Yes, but I think it would be a little “off-topic”, unless you found a bacteria that directly acted on hepcidin (hepcidin is also an anti-microbial peptide, its expression is increased during inflammation). <br/>
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Pour bénéficier du témoignage des thalassémiques vous devez contacter l'association de malades. N'ayant pas ses coordonnées je vous suggère soit de chercher sur internet, soit de contacter François FAURISSON qui connait cette association : francois....@inserm.fr<br>
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<b>Q3: Would it be interesting to scavenger Fe<sup>3+</sup> iron in food ? </b><br/>
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J'ai eu un long entretien avec lui concernant une enquête sur la relation entre les chercheurs et les associations de malades. Peut-être se souviendra t-il de moi.<br>
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Yes, that would be a good idea. You could also think to inactivate a protein implied in iron transport by duodenum enterocytes.<br/>
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***
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<b> Q4: What is the affinity of ferroportine (<i>iron-regulated transporter that transport iron from intestine cells to blood</i>) for iron? </b><br/>
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We still have no idea! The 3D structure of Ferroportin is still unknown, 15 years after its discovery and there is still a controversy about the localization of it C-terminal extremity. <br/>
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Nous avons ensuite entamé une discussion ouverte et une série de questions/réponses. Au cours de celle-ci de très nombreuses questions m'ont été posées, témoignant d'une curiosité scientifique de tout le monde dont le but semble, à l'évidence, de rendre le projet encore plus efficace. Ils m'ont tous semblés prêts à prendre en considération certaines difficultés mentionnées ci-dessus. Néanmoins il ne faudrait pas que ces difficultés rendent le projet "infaisable" et voulant le rendre trop parfait. Le temps pour le monter est très court et il faut sans doute faire des choix (Nicola sinsistant sur le fait qu'il faut faire quelque chose de simple et je suis d'accord sur ce point).<br>
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<b>Q5: Is there a mouse model for hemochromatosis available in your laboratory? And could we possibly use it?</b><br/>
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Yes, totally, you could use it. <br/>
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<b>Q6: How could we give our bacteria to the mouse?</b><br/>
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The simplest way would be by forced-feeding. <br/>
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<b>Q7: Is this something you know how to do?</b><br/>
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Yes sure.<br/>
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<b>Q8: Would it be interesting to model iron homeostasis in mammals? </b><br/>
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Yes, it would be a great idea! Furthermore is largely uncharted territory! I have also no doubts that microbiote iron homeostasis and mammal iron homeostasis are link. It will be a very productive topic in the next years. Each project and each project will provide data about it. A journey of a thousand miles begins with a single step!<br/><br/></p>
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Je n'ai pas retenu toutes les questions mais en voici quelques unes en vrac :<br>
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<p>Dr Nicolas gives us a review he made on iron homeostasis in mammals (mouse and human). The review is only available in french and was made for non-scientist, you can find it there (link of the pdf).<br/>
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Q1 : Est ce qu'un modèle murin d'hémochromatose est disponible chez vous et est ce qu'on pourrait y avoir accès ?
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R1 : Oui tout à fait. Cela ne me semble pas poser de problème.<br>
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Q2 : Comment administrer la bactérie à la souris ?<br>
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Gaël Nicolas then give us detail about french patient association and contacts. He also encourages us to contact Professor Pierre Brissot, who is a doctor and a researcher constantly in contact with patients.<br/><br/>
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R2 : Le plus simple est par gavage.<br>
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Q3 : C'est un geste que vous maitrisez ?<br>
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R3 : Oui tout à fait.<br>
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Q3 : Quelle quantité de fer absorbe un patient hémochromatosique.<br>
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Gaël Nicolas wished us to enjoy our project realization and that iGEM strengthen our scientific interest, and finally he wished us good luck for the competition.</p>  
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R3 : On considère que c'est 10 fois plus qu'une personne saine. Une alimentation équilibrée de type européenne apporte 20 milligrammes de fer mais seul 1 milligramme est absorbé. Dans l'hémochromatose on considère que cela peut monter à 10 milligrammes et même plus dans les cas les plus sévères.<br>
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Q4 : Serait-il intéressant d'agir directement sur l'hormone hepcidine ?<br>
 
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R4 : Oui. Mais c'est peu "hors sujet" par rapport au projet proposé là à moins de trouver une bactérie qui agisse directement sur l'hepcidine (nous avons alors discuté du fait que l'hepcidine est aussi un peptide anti-microbien et que son expression est fortement augmentée lors d'une inflammation).<br>
 
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Q6 : Serait-il intéressant de bloquer le fer sous sa forme Fe3+ dans la nourriture ?<br>
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<h2>The clinical point of view</h2>
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R6 : Oui c'est une bonne idée. On peu aussi envisager une stratégie visant à inactiver l'une des protéines impliquées dans le transport du fer par les entérocytes du duodénum.<br>
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Q7 : Quelle est l'affinité de la ferroportine pour le fer ?<br>
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<h3>Discussing with Professor P. Brissot, a specialist clinician</h3>
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R7 : On n'en a aucune idée (je précise maintenant que sa structure 3D est inconnue. Presque 15 ans après sa découverte il existe encore une controverse pour savoir si son extrémité C-terminale est cytoplasmique ou à l'extérieure de la cellule !!!).
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Q8 : Serait-il intéressant de modéliser l'homéostasie du fer des mammifères ?<br>
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R8 : Oui beaucoup. D'autant plus que c'est un domaine totalement inexploré. Je vous encourage à le faire ou à en parler.
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De mon côté j'ai insisté sur le côté novateur de ce projet puisqu'il fait rejoindre deux thématiques actuellement séparées : l'homéostasie du fer du microbiote et l'homéostasie du fer des mammifères. Je n'ai aucun doute qu'il existe des relations entre elles deux et qu'il s'agit là d'un sujet d'avenir qui sera très productif dans les prochaines années. Sachant qu'il y a tout à y découvrir chaque projet et chaque expérience apportera son lot de données nouvelles. Un long voyage commence toujours par un pas !<br>
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Nous avons également évoqué la possibilité de mélanger la bactérie recombinante directement dans les aliments ("Passe moi le sel et passe moi les bactéries" - Guillaume) de façon à ce qu'elle piège le fer bien avant de ne se retrouve dans le duodénum.<br>
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<img src='http://www.tif2013.org/wp-content/uploads/2013/05/Prof-P-Brissot-picture-website.png' alt='Pierre Brissot' align='right' style="margin-left:20px;" height='150px'/>  
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Quelqu'un a demandé s'il est possible de bénéficier du témoignage d'un patient qui supporterait mal les saignées et qui serait intéressé par le dévelopement d'une alternative thérapeutique. J'ai suggéré de contacter l'Association Hémochromatose France qui est une association de plusieurs milliers d'hémochromatosiques. Elle est dirigée par le professeur Henri Michel. Un bulletin de l'association est publié régulièrement. On peut y lire régulièrement les témoignages de ces patients. Je ne manquerai pas de vous faire parvenir les prochains bulletins que je reçois (probablement le prochain au cours de l'été - il me faudrait une adresse postale !). J'ai également suggéré de contacter le professeur Pierre Brissot qui est un médecin hépatologue/chercheur de Rennes constamment au contact des malades.<br>
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<p> Pierre Brissot is a hospital practitioner and university professor in the Rennes Pontchaillou hospital. He is responsible for the national center for rare genetic iron overload disorders and is on of the founders of the <a href="http://efaph.eu/" target='_blank'>EFAPH</a> (European Federation of Association of Patients with Haemochromatosis). Thanks to his experience as a medical practitioner, he was able to advise us on our project, particularly on the diagnostics of the illness and its treatment. As did Gaël Nicolas, he found our project innovative and possibly achievable (See <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Seminar#Feel">impressions from the seminar</a>)
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</p>
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Comme convenu veuillez trouver ci-jointe la revue dont je vous ai parlée et intitulée : "Iron-responsive bacterial small RNAs: variations on a theme".<br>
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<div style="clear:both;"></div>
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<h3>Asking the president of patients' associations </h3>
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Je joins également une revue que j'ai écrite en 2009 sur la régulation de l'homéstasie du fer chez les mammifères (Homme, souris). L'éditeur m'avait demandé d'écrire une revue pour les personnes ayant très peu de connaissances dans le domaine. Elle est donc relativement simple. D'autres, plus complexes, sont évidemment disponibles.<br>
 
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<img src='https://static.igem.org/mediawiki/2013/9/98/Hemochr.jpg' alt='RDV 04/09/2013' align='left' style="margin-right:20px;" height='300px'/>
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Enfin je vous suggère fortement de contacter la société Vifor pour tenter d'établir un sponsoring.<br>
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<p>Hervé Ségalen is the president of the <a href="http://sites.google.com/site/hemochromatoseiledefrance/" target='_blank'>AHP</a> (Association Hemochromatose Paris île de France) that we contacted in July. He edited our <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/HumanPractice/Patients_perceptions">survey</a> in order to make it understandable by <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Hemochromatosis">hemochromatosis</a> patients, and gave us his opinion on our project as a <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Project_diseases#Hemochromatosis">hemochromatosis</a> patient. Finally, he passed on our <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/HumanPractice/Patients_perceptions">survey</a> to the patients who are part of the AHP association.</p>
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Divers :
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<p>Brigitte Pineau is the president of <a href="http://www.hemochromatose.org/" target='_blank'>FFAMH</a> (Fédération Française des Associations de Malades de l'Hémochromatose- French Federation of Hemochromatosis patients' unions). She also passed on our <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/HumanPractice/Patients_perceptions">survey</a> to patients, as well as to Professor Henri Michel, president of the <a href="http://www.hemochromatose.fr/" target='_blank'>AHF</a>  (Association Hémochromatose France - France Hemochromatosis association). On the 4th of September, we met Brigitte Pineau and Hervé Ségalen in order to prepare the <a href="https://2013.igem.org/Team:Evry/Seminar">seminar</a> we organized on the 18th of September and to explain our project to them in more detail.
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Un aspect n'a pas été discuté : l'apport de fer sous forme héminique (= contenu dans la viande) est très importante.
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N'oubliez pas de vérifier la constante d'affinité de l'aérobactine et de l'entérobatine pour le fer :o)))<br>
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Bonne chance à tous. Je vous souhaite que ce concours renforce votre passion scientifique et que vous profitiez à fond de cette expérience enrichissante et rare.<br>
 
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Enfin je vous souhaite bien entendu d'accéder en finale.<br>
 
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Latest revision as of 02:13, 29 October 2013

Iron coli project


Consultation of experts

During our project, we contacted different experts on hemochromatosis : patients, clinicians and specific researchers.

The scientific point of view

Gaël Nicolas

Doctor Gaël Nicolas is a French scientist who is working on the regulation of hepcidin expression. He described in 2001 for the first time the role of this hormone in the regulation of iron homeostasis in mammals.
(See Gaël Nicolas resume for more information)

The meeting took place at Cochin Institut, on the 18 June 2013.


We first presented the aim of iGEM competition and iGEM Evry team to Gaël Nicolas. We mentioned the pluridisciplinary aspect of iGEM: biology, engineering, mathematic and informatic modelling and ethic and philosophic reflection on our project ; this aspect interested Dr. Nicolas very much.
We then described our experimental strategy to create a bacteria that can chelate iron: our goal is to design a bacteria that produces a massive amount of siderophores when iron from food arrives.
We then presented the different parts of modelling: bacterial growth of our bacteria, risks for patients, amount of absorbed chelated, modelling of the intestine.
Finally we discussed the use of microfluidics to study the ability of our bacteria to chelate iron.

Gaël Nicolas then focused on some points:

  • Naturally, there are not a lot of bacteria in the duodenum (only 10 to 100 bacteria for each gram of matter). But we underlined that could be an advantage for our project, and Dr. Nicolas agreed with us.
  • Incomplete penetrance (proportion of individuals carrying a particular variant of a gene which express an associated trait) with homozygote HFE C282Y mutation (responsible of more than 95% of genetic hemochromatosis). There is a 1:300 proportion of French population that have homozygote HFR C282Y mutation but all of them do not develop hemochromatosis, which reduces the proportion of people that could be interested by our treatment.
  • Thalassemia seems like more appropriate for the application of our project. Thalassemia is severe anemia due to a defect in hemoglobin’s globin (alpha or beta) production. There is a default of red cells production. The only way to treat this anemia is blood transfusion. But each transfusion also provides a huge amount of iron: 200 mg (as total iron in human body is between 3 and 5 grams, the mass of a nail!). After a dozen transfusions, patients develop a secondary iron overload also called secondary hemochromatosis (secondary to transfusion).
    Furthermore, their organisms “misinterpret” this anemia: anemia is perceived as a result of lack of iron. Hence, there is a repression of hepcidin hormone synthesis (which regulates negatively iron absorption in the intestines).
    The consequence is that there is a massive absorption of alimentary iron (10 to 20 times more than a healthy person). Due to this iron absorption, iron overload in blood is even more important, it is a vicious circle! This is really terrible since, because of their anemia, bloodletting is impossible!
    The only treatment to decrease this dangerous iron overload is the administration by perfusion of an iron chelator, 12 hours a day, 5 days a week; which is very difficult for patients. Oral iron chelator Exjade (Deferasirox) is very problematic because of the important side effects (e.g. renal failure). It is actively keep under surveillance by the French Agency for the Safety of Health Products (APFSAP). Iron chelator treatments are used during the whole life of thalassemia patients because most of them die of iron overload, more than from anemia. Thalassemia patients are people who have a very important disease and alternative treatment would be a good thing.
  • Gaël Nicolas also told us that heminic iron (from meat) is very important source of iron, we have to take that into account.
  • He finally reminded us to check affinities of aerobactin and enterobactin (two bacterial siderophors) for iron.


We then opened a discussion and a series of questions and answers:
Q1: How much iron can a hemochromatosis patient absorb?
10 times the amount of a healthy person. A balanced diet of a European type provides 20 milligram of iron but just 1 milligram is absorb by organism. In hemochromatosis patient, it could go to 10 milligrams and even higher in severe cases.
Q2: Would it be interesting to act directly on the hepcidin hormone?
Yes, but I think it would be a little “off-topic”, unless you found a bacteria that directly acted on hepcidin (hepcidin is also an anti-microbial peptide, its expression is increased during inflammation).
Q3: Would it be interesting to scavenger Fe3+ iron in food ?
Yes, that would be a good idea. You could also think to inactivate a protein implied in iron transport by duodenum enterocytes.
Q4: What is the affinity of ferroportine (iron-regulated transporter that transport iron from intestine cells to blood) for iron?
We still have no idea! The 3D structure of Ferroportin is still unknown, 15 years after its discovery and there is still a controversy about the localization of it C-terminal extremity.
Q5: Is there a mouse model for hemochromatosis available in your laboratory? And could we possibly use it?
Yes, totally, you could use it.
Q6: How could we give our bacteria to the mouse?
The simplest way would be by forced-feeding.
Q7: Is this something you know how to do?
Yes sure.
Q8: Would it be interesting to model iron homeostasis in mammals?
Yes, it would be a great idea! Furthermore is largely uncharted territory! I have also no doubts that microbiote iron homeostasis and mammal iron homeostasis are link. It will be a very productive topic in the next years. Each project and each project will provide data about it. A journey of a thousand miles begins with a single step!

Dr Nicolas gives us a review he made on iron homeostasis in mammals (mouse and human). The review is only available in french and was made for non-scientist, you can find it there (link of the pdf).
Gaël Nicolas then give us detail about french patient association and contacts. He also encourages us to contact Professor Pierre Brissot, who is a doctor and a researcher constantly in contact with patients.

Gaël Nicolas wished us to enjoy our project realization and that iGEM strengthen our scientific interest, and finally he wished us good luck for the competition.

The clinical point of view

Discussing with Professor P. Brissot, a specialist clinician

Pierre Brissot

Pierre Brissot is a hospital practitioner and university professor in the Rennes Pontchaillou hospital. He is responsible for the national center for rare genetic iron overload disorders and is on of the founders of the EFAPH (European Federation of Association of Patients with Haemochromatosis). Thanks to his experience as a medical practitioner, he was able to advise us on our project, particularly on the diagnostics of the illness and its treatment. As did Gaël Nicolas, he found our project innovative and possibly achievable (See impressions from the seminar)

Asking the president of patients' associations

RDV 04/09/2013

Hervé Ségalen is the president of the AHP (Association Hemochromatose Paris île de France) that we contacted in July. He edited our survey in order to make it understandable by hemochromatosis patients, and gave us his opinion on our project as a hemochromatosis patient. Finally, he passed on our survey to the patients who are part of the AHP association.

Brigitte Pineau is the president of FFAMH (Fédération Française des Associations de Malades de l'Hémochromatose- French Federation of Hemochromatosis patients' unions). She also passed on our survey to patients, as well as to Professor Henri Michel, president of the AHF (Association Hémochromatose France - France Hemochromatosis association). On the 4th of September, we met Brigitte Pineau and Hervé Ségalen in order to prepare the seminar we organized on the 18th of September and to explain our project to them in more detail.